Furnas liegt zu Beginn des östlichen Drittels von São Miguel in einer ausgedehnten Caldera, die von allen Seiten mit bis zu 760 m hohen, bewaldeten Kraterwänden umgeben ist.
Das Dorf liegt auf rund 270 m im Tal Vale das Furnas, das vulkanischen Ursprungs ist, etwa 6 km an Länge und 5 km an Breite misst und eher einer Mulde als einem Tal ähnelt. Das Tal hat ein eigenes Mikroklima, dessen Luftfeuchtigkeit und mittlere Temperatur über den Durchschnittswerten der Insel São Miguel liegen, so dass die Vegetation verschiedene Arten wie Zedern und Araukarien umfasst, die sonst in dieser geographischen Breite nicht gedeihen könnten. Es entspringen insgesamt 23 warme bis heisse Mineralquellen und Caldeiras genannte Fumarolen mit bis zu 98 Grad Wassertemperatur.
Die Vulkanaktivitäten zeigen sich hauptsächlich in den sogenannten Caldeiras. Dabei handelt es sich um dampfende Stellen kochenden Wassers. Sie sind die, von weitem sichtbare, Hauptattraktion von Furnas. Ihr nicht vor Ort trinkbares schwefelhaltiges Wasser wird nicht nur zum Essenkochen benutzt, sondern dient zum Beispiel auch zur Teezubereitung.
Der 176 ha grosse See Lagoa das Furnas ist wegen der zahlreichen Fumarolen und Solfataren an seinem Rand bekannt.
